La industria biotecnológica actual exige procesos rápidos y económicos para la producción y la purificación de biomoléculas. En este contexto, diferentes técnicas separativas que ofrezcan un alto rendimiento y una alta pureza del producto final han sido evaluadas por diferentes grupos de investigación. La extracción líquido-líquido con sistemas bifásicos acuosos (SBAs) es una de las metodologías más estudiadas para bio-separación. Esta técnica presenta varias ventajas, tales como condiciones suaves de trabajo, alta relación costo-beneficio, cortos tiempos de consumo y alto porcentaje de recuperación del producto final. Con el objetivo de comparar extracciones líquido-líquido con otras técnicas de separación, diferentes procesos de extracción de biomoleculas serán presentados en este trabajo de revisión. Adicionalmente, se presentaran las ventajas y desventajas de cada uno de ellos. En general, los más altos grados de pureza del producto final fueron obtenidos al combinar diferentes metodologías, siendo las cromatográficas las más aplicados en las últimas etapas debido a los elevados factores de purificación obtenidos después de ellas. Metodologías alternativas como por ejemplo, SBAs basados en mezclas de PEG/sal o liquídos iónicos/sal, sistemas micelares de dos fases acuosas (SMDFAs) formados por solventes o surfactantes; fermentación extractiva utilizando SBA, también resultan ser relevantes debido a sus bajos costos y cortos tiempo en sus procesos de purificación.